相辅相成，一个提供素材，一个整合各种功能

和maxwjj的答案正好相反，先有的是designer，用来设计程序纹理，也可以设计各种滤镜和基本工具。因为不是对美术友好的工具，后来出现了painter，比较容被美术接受，painter里的PBR材质球和所有的滤镜工具，原始mask都来自designer， 可以说designer为painter制作资源库和工具包，并且可以不断让painter更加强大。

painter是制作纹理贴图,designer是制作着色器

Substance Designer 侧重是在你制作一个材质的各种功能性，比如缩放分辨率，调整高光等等
Painter则是为Designer提供了素材，比如手绘的高光贴图，法线贴图等，最终这些题图的功能还是要在Designer里面来完成输出。